Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2BQ00403 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms