Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNAQ00169 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms