Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKD1P98161 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKD1P98161 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKD1P98161 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKD1P98161 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKD1P98161 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKD1P98161 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKD1P98161 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKD1P98161 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms