Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms