Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPEP62304 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPEP62304 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms