Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF7P61962 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF7P61962 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF7P61962 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms