Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVPABLB-1P60509 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms