Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC4P56524 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC4P56524 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms