Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3BP55884 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms