Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFERP55789 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFERP55789 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFERP55789 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GFERP55789 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFERP55789 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFERP55789 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFERP55789 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFERP55789 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFERP55789 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFERP55789 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFERP55789 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFERP55789 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFERP55789 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFERP55789 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFERP55789 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFERP55789 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFERP55789 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.1 ms