Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA3P52797 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms