Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV2P52735 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV2P52735 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV2P52735 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV2P52735 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV2P52735 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV2P52735 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV2P52735 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV2P52735 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV2P52735 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV2P52735 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV2P52735 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV2P52735 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV2P52735 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV2P52735 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV2P52735 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV2P52735 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV2P52735 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV2P52735 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV2P52735 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV2P52735 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV2P52735 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV2P52735 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV2P52735 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV2P52735 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms