Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB3P49720 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMB3P49720 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB3P49720 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms