Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR3P49682 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCR3P49682 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR3P49682 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms