Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCAR3P49019 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCAR3P49019 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms