Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCP4P48539 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCP4P48539 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCP4P48539 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCP4P48539 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCP4P48539 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCP4P48539 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCP4P48539 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCP4P48539 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCP4P48539 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCP4P48539 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCP4P48539 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCP4P48539 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCP4P48539 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCP4P48539 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCP4P48539 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms