Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLMP48507 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLMP48507 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLMP48507 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLMP48507 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLMP48507 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLMP48507 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLMP48507 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLMP48507 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCLMP48507 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLMP48507 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLMP48507 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLMP48507 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLMP48507 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLMP48507 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLMP48507 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLMP48507 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLMP48507 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLMP48507 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLMP48507 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLMP48507 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLMP48507 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLMP48507 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLMP48507 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLMP48507 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLMP48507 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLMP48507 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLMP48507 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLMP48507 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLMP48507 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLMP48507 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLMP48507 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLMP48507 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLMP48507 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLMP48507 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLMP48507 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLMP48507 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLMP48507 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms