Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGIRP43119 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGIRP43119 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms