Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH1P40692 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH1P40692 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH1P40692 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH1P40692 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH1P40692 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH1P40692 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH1P40692 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH1P40692 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH1P40692 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH1P40692 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH1P40692 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLH1P40692 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLH1P40692 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH1P40692 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLH1P40692 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLH1P40692 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLH1P40692 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLH1P40692 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms