Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FEN1P39748 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FEN1P39748 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FEN1P39748 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FEN1P39748 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FEN1P39748 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FEN1P39748 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FEN1P39748 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FEN1P39748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FEN1P39748 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FEN1P39748 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FEN1P39748 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FEN1P39748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FEN1P39748 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FEN1P39748 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FEN1P39748 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FEN1P39748 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FEN1P39748 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FEN1P39748 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FEN1P39748 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FEN1P39748 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FEN1P39748 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms