Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGCXP38435 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGCXP38435 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGCXP38435 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGCXP38435 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGCXP38435 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGCXP38435 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGCXP38435 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGCXP38435 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGCXP38435 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGCXP38435 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGCXP38435 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGCXP38435 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGCXP38435 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGCXP38435 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGCXP38435 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGCXP38435 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGCXP38435 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGCXP38435 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGCXP38435 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGCXP38435 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGCXP38435 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GGCXP38435 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGCXP38435 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGCXP38435 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGCXP38435 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGCXP38435 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGCXP38435 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGCXP38435 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGCXP38435 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGCXP38435 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGCXP38435 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGCXP38435 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGCXP38435 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGCXP38435 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGCXP38435 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGCXP38435 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGCXP38435 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGCXP38435 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGCXP38435 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGCXP38435 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGCXP38435 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGCXP38435 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGCXP38435 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms