Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TGFBR1P36897 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGFBR1P36897 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms