Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB2P35606 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB2P35606 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB2P35606 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COPB2P35606 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COPB2P35606 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB2P35606 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB2P35606 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB2P35606 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB2P35606 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB2P35606 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB2P35606 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB2P35606 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB2P35606 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB2P35606 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB2P35606 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB2P35606 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB2P35606 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB2P35606 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COPB2P35606 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB2P35606 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB2P35606 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB2P35606 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB2P35606 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB2P35606 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB2P35606 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB2P35606 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB2P35606 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB2P35606 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB2P35606 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB2P35606 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB2P35606 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB2P35606 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB2P35606 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB2P35606 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB2P35606 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB2P35606 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB2P35606 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB2P35606 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB2P35606 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB2P35606 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB2P35606 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB2P35606 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB2P35606 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB2P35606 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COPB2P35606 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPB2P35606 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPB2P35606 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPB2P35606 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms