Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 34.18□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 33.19□□□□□ -1.92e-9■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.311e-55■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.829e-15■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 58.32□□□□□ -1.089e-15■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.159e-15■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 ABCA2-211ENST00000464520 886 ntTSL 227.15■■□□□ 1.942e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-220ENST00000532361 970 ntTSL 1 (best)25.65■■□□□ 1.72e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.622e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.382e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 PPP2R3B-208ENST00000479438 1090 ntTSL 223.38■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-215ENST00000530360 736 ntTSL 523.11■■□□□ 1.292e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-217ENST00000531437 802 ntTSL 522.9■■□□□ 1.262e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.132e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.132e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 PPP2R3B-206ENST00000477110 5802 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-214ENST00000529351 1079 ntTSL 521.76■■□□□ 1.072e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-229ENST00000629602 537 ntTSL 420.37■□□□□ 0.852e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-221ENST00000532459 578 ntTSL 220.04■□□□□ 0.82e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-212ENST00000528936 569 ntTSL 519.97■□□□□ 0.792e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-223ENST00000533385 746 ntTSL 519.97■□□□□ 0.792e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-226ENST00000625752 709 ntTSL 519.42■□□□□ 0.72e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 HSPG2-204ENST00000412328 828 ntTSL 219.24■□□□□ 0.672e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-230ENST00000629634 579 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 418.3■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-213ENST00000529066 558 ntTSL 418.21■□□□□ 0.512e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 ABCA2-220ENST00000490486 666 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-211ENST00000528606 741 ntTSL 517.4■□□□□ 0.382e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-219ENST00000531534 824 ntTSL 516.79■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SEPT9-226ENST00000589920 580 ntTSL 216.4■□□□□ 0.227e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-218ENST00000531514 641 ntTSL 416.08■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-222ENST00000532484 839 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 HSPG2-201ENST00000374673 538 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SEPT9-209ENST00000585638 565 ntTSL 415.87■□□□□ 0.137e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 CBL-205ENST00000637974 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.51■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-224ENST00000625316 608 ntTSL 415.45■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SLC25A22-204ENST00000524891 560 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.087e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 TTC7B-206ENST00000555005 2730 ntTSL 214.21□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 DAB1-210ENST00000485760 2668 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-202ENST00000419242 852 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 AMPD2-204ENST00000369840 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.65□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 LRP5L-205ENST00000468442 600 ntTSL 311.35□□□□□ -0.592e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 TTC7B-209ENST00000556490 685 ntTSL 310.35□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-208ENST00000467063 458 ntTSL 38.84□□□□□ -0.992e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-206ENST00000456980 1036 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-205ENST00000453710 744 ntTSL 57.88□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-204ENST00000426139 836 ntTSL 57.84□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 NOL10-203ENST00000431319 827 ntTSL 36.51□□□□□ -1.372e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 TTC7B-207ENST00000555239 591 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 OMA1-211ENST00000482274 352 ntTSL 55.86□□□□□ -1.472e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 TTC7B-210ENST00000556749 526 ntTSL 45.18□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 PDZD8-204ENST00000489491 289 ntTSL 24.07□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 SRPK2-215ENST00000493638 715 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 42.2
GTF2F1P35269 PHF19-213ENST00000487555 1092 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 PHF19-211ENST00000474402 578 ntTSL 412.16□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 PHF19-206ENST00000453868 565 ntTSL 511.58□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.897e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.77e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.743e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.423e-7■■■■■ 42.1
GTF2F1P35269 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-11■■■■■ 42
GTF2F1P35269 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 327.04■■□□□ 1.921e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 26.33□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 42
GTF2F1P35269 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 PCSK6-212ENST00000560785 507 ntTSL 414.1□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 PCSK6-205ENST00000558433 543 ntTSL 413.76□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 41.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 603.4 ms