Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H1P32780 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2H1P32780 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H1P32780 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms