Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD1P28289 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD1P28289 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms