Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTSSP25774 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTSSP25774 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTSSP25774 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSSP25774 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTSSP25774 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTSSP25774 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSSP25774 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSSP25774 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSSP25774 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSSP25774 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSSP25774 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSSP25774 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSSP25774 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSSP25774 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSSP25774 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSSP25774 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSSP25774 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSSP25774 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSSP25774 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSSP25774 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSSP25774 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSSP25774 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTSSP25774 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSSP25774 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSSP25774 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSSP25774 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSSP25774 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSSP25774 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTSSP25774 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms