Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRDP23468 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRDP23468 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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