Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB6AP20340 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6AP20340 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms