Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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