Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCLP18206 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCLP18206 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCLP18206 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCLP18206 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCLP18206 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCLP18206 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCLP18206 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCLP18206 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCLP18206 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCLP18206 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCLP18206 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCLP18206 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCLP18206 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCLP18206 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VCLP18206 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCLP18206 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCLP18206 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCLP18206 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCLP18206 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCLP18206 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCLP18206 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCLP18206 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCLP18206 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCLP18206 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCLP18206 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCLP18206 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCLP18206 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCLP18206 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCLP18206 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCLP18206 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCLP18206 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCLP18206 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCLP18206 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCLP18206 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCLP18206 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCLP18206 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCLP18206 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCLP18206 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCLP18206 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCLP18206 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VCLP18206 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VCLP18206 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCLP18206 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCLP18206 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCLP18206 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCLP18206 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCLP18206 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms