Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XBP1P17861 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XBP1P17861 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XBP1P17861 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XBP1P17861 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XBP1P17861 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XBP1P17861 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XBP1P17861 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XBP1P17861 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XBP1P17861 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XBP1P17861 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XBP1P17861 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XBP1P17861 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XBP1P17861 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XBP1P17861 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
XBP1P17861 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XBP1P17861 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XBP1P17861 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XBP1P17861 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XBP1P17861 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XBP1P17861 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XBP1P17861 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XBP1P17861 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XBP1P17861 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XBP1P17861 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XBP1P17861 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XBP1P17861 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XBP1P17861 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XBP1P17861 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XBP1P17861 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XBP1P17861 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XBP1P17861 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XBP1P17861 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XBP1P17861 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XBP1P17861 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XBP1P17861 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XBP1P17861 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XBP1P17861 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XBP1P17861 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XBP1P17861 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XBP1P17861 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XBP1P17861 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XBP1P17861 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms