Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1P17174 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1P17174 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1P17174 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1P17174 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOT1P17174 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOT1P17174 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GOT1P17174 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT1P17174 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT1P17174 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT1P17174 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT1P17174 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT1P17174 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOT1P17174 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOT1P17174 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOT1P17174 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOT1P17174 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT1P17174 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT1P17174 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT1P17174 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOT1P17174 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1P17174 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1P17174 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOT1P17174 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOT1P17174 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOT1P17174 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOT1P17174 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOT1P17174 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOT1P17174 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOT1P17174 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms