Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A2P16615 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms