Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNB3P16520 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNB3P16520 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB3P16520 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB3P16520 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB3P16520 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB3P16520 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB3P16520 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB3P16520 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB3P16520 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB3P16520 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB3P16520 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB3P16520 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GNB3P16520 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB3P16520 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB3P16520 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNB3P16520 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNB3P16520 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNB3P16520 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNB3P16520 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms