Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPNP16150 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPNP16150 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPNP16150 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPNP16150 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPNP16150 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPNP16150 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPNP16150 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPNP16150 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPNP16150 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPNP16150 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPNP16150 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPNP16150 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPNP16150 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPNP16150 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPNP16150 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPNP16150 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPNP16150 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPNP16150 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPNP16150 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPNP16150 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNP16150 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNP16150 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNP16150 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNP16150 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNP16150 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPNP16150 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPNP16150 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms