Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DOBP13765 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms