Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCANP13611 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCANP13611 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VCANP13611 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCANP13611 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCANP13611 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCANP13611 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCANP13611 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCANP13611 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCANP13611 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCANP13611 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCANP13611 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCANP13611 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCANP13611 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCANP13611 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VCANP13611 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VCANP13611 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCANP13611 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VCANP13611 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCANP13611 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCANP13611 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCANP13611 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCANP13611 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCANP13611 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCANP13611 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCANP13611 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCANP13611 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCANP13611 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCANP13611 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCANP13611 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCANP13611 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms