Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HSPD1P10809 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSPD1P10809 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPD1P10809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms