Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HKR1P10072 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HKR1P10072 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HKR1P10072 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HKR1P10072 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HKR1P10072 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HKR1P10072 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HKR1P10072 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HKR1P10072 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HKR1P10072 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HKR1P10072 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HKR1P10072 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HKR1P10072 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HKR1P10072 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HKR1P10072 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HKR1P10072 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HKR1P10072 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HKR1P10072 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HKR1P10072 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HKR1P10072 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms