Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VSIG8P0DPA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms