Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM6P0DI80 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms