Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A2P08572 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A2P08572 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A2P08572 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms