Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN1P07384 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN1P07384 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms