Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB2P05107 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms