Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MT-ND1P03886 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND1P03886 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms