Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRAP01903 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRAP01903 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms