Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL3O95573 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms