Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF1O95521 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF1O95521 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms