Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN4O95460 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MATN4O95460 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN4O95460 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN4O95460 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MATN4O95460 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MATN4O95460 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN4O95460 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN4O95460 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN4O95460 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN4O95460 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MATN4O95460 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MATN4O95460 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN4O95460 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN4O95460 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN4O95460 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN4O95460 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN4O95460 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN4O95460 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN4O95460 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms